По различным данным насчитывается от 3 до 9 подвидов ягуара, из к-рых как минимум 1 (Техасский) истреблён:
Panthera onca onca (Амазонский ягуар)обитает в дождевых лесах Амазонии, номинативный подвид;
Panthera onca peruvianus (Перуанский ягуар) — в Перу и Эквадоре, часто включается в Амазонский подвид;
Panthera onca hernandesii (Мексиканский ягуар) — в Мексике;
Следующие 4 подвида часто включаются к Мексиканскому ягуару:
Panthera onca arizonensis (Аризонский ягуар) — от юга штата Аризона до Соноры в Мексике;
Panthera onca centralis (Центральноамериканский ягуар) — в Центральной Америке;
Panthera onca goldmani (Ягуар Голдмана) — в Мексике, Белизе и Гватемале;
Panthera onca veracrucis (Техасский ягуар) — в центральном Техасе (истреблён);
Panthera onca palustris (Бразильский ягуар) — в Южной Бразилии;
Panthera onca paraguensis (Парагвайский ягуар) — в Парагвае, часто включается в Бразильский подвид;
