Доказанное происхождение домашних кошек от мелких диких кошек свидетельствует о том, что их изначальные черты были постепенно модифицированы для благоприятного выживания в естественной среде. Постепенно, в результате ныне известных генетических мутаций появились длинная шерсть и сплошной окрас наряду с тебби-рисунком. Ген разбавления способствовал появлению голубых и других более привлекательных светлых окрасов шерсти. Ген белой пятнистости привёл к появлению калико и других четких би-колорных окрасов. Кошки, которые происходили из разных частей света, начали разниться по своим физическим характеристикам, включая длину и текстуру шерсти, образец рисунка и даже преобладание одного окраса. В некоторых случаях полная географическая изоляция приводила к интенсивному инбридингу, который закреплял определенные генетические характеристики, делая всех потомков похожими друг на друга. Именно в то время была подготовлена почва для появления разнообразных вариаций, которые сегодня получили название аборигенных (естественных) пород кошек и которыми сегодня все так восхищаются и стараются их сохранить.
Египетская Мау - одна из старейших известных аборигенных пород кошек. Эти изящные короткошерстные кошки с пятнистой шерстью были изображены на египетских рисунках, датированных 1400 г. до нашей эры. На рисунках они показаны не только как умелые охотники, но и как домашние любимцы. Современные представители абиссинской породы чрезвычайно напоминают древних египетских кошек, воспроизводимых в картинах и скульптурах и более других похожих на африканскую дикую кошку. Некоторые из кошачьих пород развивались в отдаленных изолированных местностях. Примером могут служить такие породы, как Турецкая Ангора и Персидская, которые считаются самыми ранними из всех известных длинношерстных пород кошек. Логично предположить, что мутация длинной шерсти возникла в холодных местностях Среднего Востока и, вероятнее всего, в России. Длинношерстные стройные Турецкие кошки были обнаружены на горных плато Курдистана в восточной Турции, а длинношерстные персидские кошки с более коренастым телом впервые попали в Европу из Ирана в конце шестнадцатого века. Первобытные кочевые племена, которые населяли когда-то эти области, вряд ли импортировали длинношерстных кошек из других мест. Скорее всего, наиболее правдоподобной является версия о мутационной природе появления длинной шерсти у кошек. Другим примером закреплённой в естественной изоляции спонтанной мутации являются бесхвостые кошки с острова Мэн, расположенном в Ирландском море. Эта мутация сохранилась в немногочисленной локальной популяции вследствие изолированности острова, где бесхвостые кошки существовали в течение нескольких столетий, сохранив в чистоте эту породу до наших дней.
Многие из пород получили своё признание потому, что были по достоинству оценены за свои охотничьи способности. Кошки - удивительные хищники, их основная добыча - мелкие млекопитающие. Врожденная ловкость тела, острое зрение, быстрая реакция и способность внезапного нападения наряду с бесконечным терпением и умением незаметно подкрадываться - все это позволяет кошке охотиться на грызунов с потрясающей проворностью. На протяжении столетий люди восхищались этими способностями и всячески поощряли их, в результате чего охотничье мастерство не утратили и современные кошки. В Азии было принято содержать кошек в древних буддийских храмах для защиты старинных манускриптов от грызунов. Кошки жили в монастырях и были изолированы от внешнего мира, сохраняя тем самым в чистоте своё происхождение. Одной из таких старинных дальневосточных пород является Корат - мощная короткошерстная серебристо-голубая мускулистая кошка из Таиланда. Сотни лет тайцы считали этих кошек символом удачи, а тайское правительство и знать боготворили этих животных. Их невозможно было встретить на улицах, только в исключительных случаях их дарили самым уважаемым людям. Даже сегодня все Кораты в Америке восходят своими родословными к Таиланду, где Кораты разводятся до сих пор. Сегодня - это одна из самых редких и оберегаемых пород, в CFA регистрируется ежегодно менее 100 ее представителей.
Некоторые породы получили признание благодаря своей примечательной внешности. Это касается японских бобтейлов, бурм, сиамских кошек… В Японию домашние кошки попали из Китая и Кореи в начале шестого века. Японские произведения искусства того времени богаты изображениями кошек, что указывает на особое понимание и признание не только их охотничьих способностей, но и красоты. У большинства нарисованных кошек - необычные короткие закрученные хвостики-помпоны и эффектный би-колорный окрас. Тематика рисунков на гравюрах и ширмах свидетельствует о том, что Японские Бобтейлы были избалованными домашними любимцами, которыми восхищались и любовались. Дифференциация отличающихся друг от друга дальневосточных кошек была отражена в старинной Книге стихов о кошках , сохранившейся в городе Аюда (1350-1767). Свитки, хранящиеся в национальной библиотеке Бангкока, содержат иллюстрации и описания таких пород как Медные кошки (ныне известны как Бурманские) и Корат. Много внимания в рукописях уделено Сиамским кошкам. Эти поразительно изящные кошки со светлым окрасом тела, длинным хвостом, темно-коричневыми отметинами и насыщенными голубыми глазами были в особом почете у королевских особ. Поскольку они были изолированы высокими стенами дворцов, чистота породы была им обеспечена. Именно эти кошки стали родоначальниками популярной сегодня Сиамской породы. Первые сиамские кошки были завезены с Дальнего Востока в Европу в конце XIX века.
Были также найдены доказательства того, что европейцы тоже рано начали различать кошек по фенотипу. Французский писатель Жорж-Луи Леклерк, граф де Бюффон (George-Louis Leclerc, Comte de Buffon) в журнале Естествознание в 1756 году четко разделил известных на то время кошек по их внешности. А к середине XIX века и англичане начали замечать различия в кошках, завезенных британскими торговцами и колонистами с разных концов света. По сравнению с хорошо знакомыми коренастыми британскими фермерскими кошками привезенные изящные, имеющие экзотическую внешность дальневосточные кошки бросались в глаза и восхищали. Именно британцы произвели переворот в общественном мнении по отношению к домашним кошкам. Они начали оценивать кошек как восхитительных домашних любимцев, а не относиться к ним лишь как к охотникам на грызунов. Первая выставка кошек была проведена в Хрустальном Дворце в Лондоне в 1871 г., а Национальный клуб кошек был основан в Англии в 1884 г. Домашние кошки обрели особый статус. Британцы постепенно совершенствовали отдельные разновидности кошек и таким образом заложили основы многих пород кошек, которые позже были импортированы в США, где и произошло их окончательное становление. Самой ранней отечественной породой, зарегистрированной в США, стали Мейн Куны. Жители Новой Англии гордились своими крупными длинношерстными кошками с огромными, как у енотов, хвостами, которые могли выживать в суровом северо-восточном климате и которых они с удовольствием выставляли на местных шоу. На первой большой выставке кошек в США, проведенной в 1895 году в Нью-Йорке, Мейн Кун был признан лучшим котом выставки. В 1906 году была основана американская ассоциация любителей кошек СFA (Cat Fanciers' Association). Ведение племенной документации, поощрение проведения выставок кошек, как способа отбора лучших представителей пород, и бурное развитие американского кошачьего движения - все это послужило стимулом для усиления уважительного отношения к породистым кошкам.
